Ну да, в движении только скриптом и можно, так как все эффекты в effects.bin статичные.

Сначала надо создать фрейм, в котором будет эффект. В BSV это объект типа Other. В его скрипт прописать команду с номером эффекта, указав в качестве фрейма данный объект. Ну типа:

dim_frm 1
findframe 0,""
emitparticle 0,6 //огонь

В справочнике по командам более подробно про неё написано.

Эффект должен появиться. Потом надо просто привязать данный фрейм к движущемуся объекту. Для этого в MWE надо прописать ему в строку Parent имя поезда, настроить координаты.